В СПМ-3 установлены специальные антитравматические кресла, позволяющие избежать травм при подрывах машины на взрывных устройствах.	Место водителя «Медведя» также оборудовано анититравматическим креслом, но другой конструкции.

С учетом итогов предварительных испытаний конструкторы Военно-инженерного центра (ведущий конструктор — Михаил Киреев) совместно со специалистами ФКУ НПО «СТиС» МВД РФ (специалисты МГТУ им. Баумана не стали участвовать в дальнейшем развитии проекта) в 2010 г. создали второй опытный образец бронированного автомобиля ВПК-3924 СПМ-3 «Медведь». По сути, это была уже совсем новая машина, да и внешне второй опытный образец «Медведя» мало чем напоминал первый. Еще большие изменения произошли внутри машины.

Стоит рассказать о защищенности СПМ-3. Как и на первом опытном образце, на новом «Медведе» применена оригинальная разнесенная дифференцированная защита. Применительно к отечественному ГОСТ Р 50963-96 по баллистической защите машина соответствует 6 классу. По противоминной защите «Медведь» соответствует — 2а/2Ь уровню по STANAG 4569. Другими словами, корпус и бронестекла машины «держат» попадание 7,62-мм бронебойной пули Б-32, выпущенной с расстояния 100 м из винтовки СВД, а также подрыв под колесом или днищем взрывного устройства, эквивалентного 7 кг тротила. При этом все члены экипажа, находящиеся внутри машины, не получат каких-либо серьезных травм или ранений. Высокий уровень противоминной защиты обеспечен за счет использования в конструкции СПМ-3 целого комплекса противоминной защиты. Это и специальная форма несущего корпуса (точнее, бронекапсулы) капотной компоновки с большой высотой размещения обитаемого отсека (клиренс машины составляет почти 500 мм), и установка так называемых «сэндвичей» — попросту многослойных полов, и монтаж специальных энергопоглощающих сидений для экипажа и десанта, и, конечно, герметизация обитаемого отделения, защищающая личный состав, находящийся внутри машины, от затекающей волны, образующейся при взрыве мины или взрывного устройства под машиной или в непосредственной близости от нее.

СПМ-3 «Медведь» способен развивать высокие скорости движения как на шоссе, так и на бездорожье.	Инженер-испытатель Евгений Васенкин и водитель-испытатель Юрий Федотов перед отправкой «Медведя» в Республику Коми. Январь 2012 г.

Форма бронекапсулы, в которой находится личный состав, не имеет колесных ниш, а различные агрегаты трансмиссии и других систем расположены на днище, под корпусом. Такая конструкция позволяет «убить двух зайцев»: при взрыве мины или взрывного устройства под СПМ-3 взрывная волна, до того как воздействовать на днище, как бы дробится теми самыми многочисленными агрегатами, подобно тому, как на берегах морские волны дробятся многочисленными бетонными ежами, установленными перед волноотбойниками на набережных. Кроме того, расположение агрегатов снаружи бронекапсулы обеспечивает удобный доступ к ним и, в случае необходимости, быструю их замену.

Благодаря системе постановки аэрозольных завес (разработка ФГУП «ФНПЦ «НИИ Прикладной химии»), способной в считанные секунды скрыть машину от прицельного огня противника, СПМ-3 может быстро выйти из-под обстрела. При этом образующаяся аэрозольная завеса скрывает «Медведь» не только в поле зрения обычных оптических приборов прицеливания и наблюдения, но и оптико-электронных, в том числе и тепловизионных.

Бронированные стекла десантного отделения оборудованы закрывающимися бойницами для ведения огня из личного оружия.