На органы военного управления легла особая нагрузка. Опробована методика ликвидации диверсионно-разведывательных групп условного противника, проверено состояние прикрытия границ Союзного государства, противовоздушной обороны пунктов управления.
20 сентября совместное оперативное учение «Запад-2013» перешло в активную фазу, которая продолжалась несколько дней. По сценарию учения на территорию Союзного государства вторгаются хорошо вооруженные и подготовленные экстремистские группы и бандформирования, цель которых - подготовка и проведение
террористических актов и дестабилизация обстановки в стране. Им оказывается внешняя поддержка в виде материально технической помощи, поставок вооружения и военного имущества. Для стабилизации обстановки на территории Союзного государства в Республику Беларусь были оперативно переброшены подразделения Вооруженных Сил Российской Федерации, которым в тесном взаимодействии с вооруженными силами Республики Беларусь предстояло блокировать и уничтожить условные незаконные бандформирования. Завершающий этап учения проходил на белорусском полигоне Гожский и на российском полигоне Хмелевка Калининградской области, где за действиями войск наблюдали Президенты Российской Федерации и Республики Беларусь Владимир Путин и Александр Лукашенко.
Экипажи фронтовых бомбардировщиков Су-24М авиагруппы Черняховск
Действие на полигоне Гожский началось 22 сентября, где сухопутные войска и авиация отрабатывали спецоперацию по отражению нападения незаконных вооруженных формирований, пытавшихся прорваться на территорию Союзного государства. По заранее спланированному сценарию колонны боевиков на автомобилях предпринимают попытку пересечь государственную границу. После их обнаружения по скоплениям условного противника наносятся авиационные удары штурмовиками Су-25 и вертолетами армейской авиации Ми-24 и Ми-8. На пути отхода «террористов» с вертолетов Ми-8 высаживается тактический десант российских и белорусских подразделений, а по позициям врага открывает огонь артиллерия. После подавления важных огневых точек в бой вступают мотострелковые подразделения, завершающие разгром условного противника.
С территории Белоруссии действие плавно переходит на Балтику на полигон Хмелевка под Калининградом, где 26 сентября развернулся розыгрыш наиболее эффектного эпизода учения «Запад-2013». Хорошо организованная вооруженная группа бандформирований захватила прибрежную территорию и 2 населенных пункта, закрепившись и организовав круговую оборону. Морским путем условному противнику непрерывно шла доставка оружия, боеприпасов, продовольствия. К месту разворачивающихся событий стягиваются вооруженные силы Российской Федерации и Республики Беларусь. Войскам поставлена задача освободить захваченную территорию и уничтожить условного врага. Отряд кораблей Балтийского Флота стягивается в район событий и организует морскую блокаду с целью воспрепятствовать доставке грузов противнику. В Балтийском море начинается розыгрыш одного из эпизодов. Несколько вражеских судов прорывают морскую блокаду и приближаются к побережью. Союзные силы наносят удар по ним с помощью РСЗО «Град». Незаметно в дело вступают боевые пловцы-минеры, закреплявшие взрывчатку под днище кораблей, которые были подорваны через несколько минут. Одновременно на одно из вражеских судов с вертолета Ми-8 высаживается спецназ, который обезвреживает его экипаж.