Автономный запуск двигателя обеспечивал стартер Plessey. Принцип работы стартера - смесь изопропилнитрата при сгорании в камере создавала давление газов, необходимое для раскручивания турбины. Запас топлива в системе позволял осуществить три запуска двигателя. Работа стартера, по воспоминаниям пилотов, сопровождалась сильным шумом (свист) и характерным запахом.

Топливная система обеспечивала подачу топлива двигателю на всех режимах полета самолета и при любом положении его в воздухе. Топливо размещалось в четырнадцати баках центроплана. Внутренний запас топлива для варианта J 35A составлял 2240 литров и на последующих моделях был увеличен до 2865 литров. Подача топлива осуществлялась электронасосами из двух расходных баков емкостью 75 литров, которые постоянно подпитывались от периферийных баков. Автоматизированная система управления осуществляла контроль расхода топлива и сохранение требуемого положение центра масс самолета на всех режимах полета. Система заправки централизованная, с пропускной способностью 830 л/мин.

На вариантах J 35A и В дополнительный 500 литровый подвесной топливный бак устанавливался на центральном фюзеляжном пилоне. Начиная с варианта J 35D, на самолетах была реализована возможность подвески до четырех подвесных топливных баков (два 500 литровых бака на крыльевых и два бака на фюзеляжных пилонах).

Катапультируемое кресло Saab 73SE-F	Демонстрация возможных вариантов подвесного вооружения самолета J 35B

Пушечное вооружение вариантов J 35A, В, D - две встроенные 30-мм пушки Aden M/55 со скорострельностью 1200 выстрелов в минуту и боезапасом по 90 снарядов, размещенных в корневой части крыла. На самолетах J 35F и J была установлена одна пушка в правом крыле. Разведывательные и учебные варианты не имели пушечного вооружения.

Три узла подвески вооружения J 35А позволяли нести внешнюю нагрузку до 1700 кг. Два крыльевых и центральный фюзеляжный Y-образный пилон обеспечивали возможность подвески до четырех ракет класса «воздух-воздух» Rb24 с ИК ГСН (лицензионный вариант американской УР AIM-9 Sidewinder). Кроме этого, самолет мог нести НАР Bofors калибром 75 мм или 135 мм и авиационные бомбы. Для установки пусковых направляющих НАР использовались дополнительные крыльевые узлы подвески.

На моделях J 35F/J количество основных узлов подвески вооружения было увеличено до шести. Максимальная масса боевой нагрузки составляла 4080 кг. Максимальная скорость полета Saab J 35F/J с четырьмя ракетами ограничивалась значением М=1,4.

Система управления J 35 обычная для самолета с треугольным крылом. В продольном канале управление обеспечивалось синхронным отклонением элевонов, в поперечном канале - дифференциальным отклонением элевонов, по курсу — отклонением руля направления. Сигналы управления от ручки и педалей передавались механически к гидравлическим сервоприводам поверхностей управления. Система управления необратимая, поэтому в контурах управления применялись автоматы загрузки. Гидравлическая система состояла из двух независимых подсистем с рабочим давлением 210 кгс/см². В случае выхода из строя двигателя, аварийный генератор с приводом от воздушной турбины обеспечивал давление, необходимое для работы подсистемы номер два (управление рулем направления и элевонами).

В канале поперечного управления передаточное соотношение между ручкой и элевонами непрерывно зависело от числа М и высоты полета, а в канале продольного управления передаточное отношение изменялось в соответствии с изменением индикаторной скорости.

Кроме основной системы управления имелась еще автоматическая система управления полетом. Сигналы автоматической системы накладывались на механические сигналы, поступающие от органов управления к сервоприводам, для улучшения характеристик управляемости, а также для уменьшения рабочей нагрузки пилота.

Комплекс радиоэлектронной аппаратуры самолета был оптимизирован для работы в составе полуавтоматической системы STRIL-60. Радиоэлектронное оборудование самолета J 35F включало систему управления оружием, объединенную с радиолокатором, навигационный радиолокатор, систему опознавания «свой-чужой» и автопилот.